2011年4月25日，珠海大横琴口岸建设开发有限公司在横琴正式注册成立。其后，为适应横琴对口岸资产经营管理和承接跨境电商业务发展等需要，推动口岸公司由项目公司向口岸综合开发运营商转型发展，公司于2015年7月更名为珠海大横琴口岸实业有限公司，注册资本由500万元增加至5亿元。

在大横琴集团公司“城市运营商+产业发展商”发展定位的指引下，口岸公司确立了两大主业：一是横琴口岸及配套设施投资、建设和运营管理，二是现代商贸物流产业和服务业，具体包括三大版块：一是口岸建设与配套商业地产开发运营；二是口岸运维与资产经营；三是商贸物流配套和现代服务业经营。

自成立以来，大横琴口岸公司紧紧围绕两大主业，全力推动横琴口岸主体工程建设，培育口岸经济和商业品牌，初步形成了以口岸建设为中心、以口岸运维为重点、以口岸商业资产经营、商贸物流、现代服务业为核心的业务发展格局。

由口岸公司投资建设的横琴口岸及综合交通枢纽项目，先后获得2022-2023年度第一批中国建设工程鲁班奖（国家优质工程奖）、中国建筑材料流通协会科技进步类一等奖、中国建筑学会科技进步奖三等奖、华夏建设科学技术奖三等奖、广东省土木工程詹天佑故乡杯等重量级奖项。

截至2024年4月底，口岸公司资产总额为197.53亿元，实现营收1.13亿元。